Desde Cuba, donde había llegado en 1519, se trasladó a Nueva España en 1520 como capitán de una de las expediciones que salieron de la isla para tratar de neutralizar a Hernán Cortés. El grupo constituía un pequeño ejército que llegó a las costas mexicanas en dos barcos. Sin embargo, Morejón de Lobera alteró sustancialmente lo que era su misión inicial, puesto que, tras llegar a Veracruz, decidió pasarse con sus hombres al bando de Cortés. Desde entonces colaboró con el caudillo en diversos episodios de la conquista aunque más tarde se distanciarían; participó en la conquista de Pánuco y murió en Centroamérica en la expedición contra Cristóbal de Olid.